兴隆山校区管理办公室是学校行政派出机构。
一、主要工作职责
兴隆山校区基础设施的发展规划和校园建设工作；校区内资产资源的管理工作；校区综合治理、物业管理、安全保卫、校园绿化美化、设备设施维护维修、基础设施修缮、院士及专家公寓服务、社区管理等服务保障工作；校区内外的沟通协调工作；接待、受理校区群众来信来访；信息的汇总与报送工作；完成学校和上级机关安排的其他工作。
二、人员编制
编制22人。其中：主任1人，副主任1人。主任为正处级，副主任为副处级。
非事业编制3人。
三、内设机构
1.综合管理科：负责建章立制；负责办公室范围内所有工作的质量监督和评价；各种活动的组织与协调；档案管理及会议室管理等；与属地政府部门联系，承担政府部门部署的有关工作（人大代表选举、山林防火、汛期防汛、安全稳定、公共卫生、消灭山林虫害等）；建立与周边单位和村级组织的联系，处理好相关利益纠纷。
编制1人。其中：科长1人。
2.物业管理科：对物业公司的工作效能和质量进行监督、管理、考核和评价；对校区水、电、气、暖、道路、桥梁、湖泊、锅炉、配电室、中央空调、教学设备等进行日常维护和管理。
编制9人。其中：科长1人 ，副科长2人。
3.修缮管理科：对校区规划提出建议；制定楼宇设施设备维护维修计划；负责维修项目的立项、实施、验收及预决算；负责兴隆山校区周边山体承租工作及周边土地拓展、拆迁、规划、建设工作。
编制2人。其中:科长1人，副科长1人。
4.资产管理科：负责校区公房的调配使用和校区固定资产的日常管理；保障学校资产安全和完好，提高资产使用效率；制止乱搭乱建、制止违规出租和使用学校公房。
编制1人。其中：科长1人。
5.安全保卫科：负责消防法规和治安法规的宣传，负责防火、防汛和维护校园秩序，保障校区安全稳定。
编制6人。其中：科长1人，教导员(正科级)1人，副科长2人。
6.南山社区办公室：指导业主大会和业主委员会建立及日常工作开展；负责政策法规宣传；负责南山小区业主投诉、计划生育管理、人口普查等工作；负责与街道办事处沟通联系。
编制1人。其中：主任（正科级）1人。